北畠顕房是公卿身份，被源义时抬家格入羽林家，只不过他的俸禄是从幕府拿的，在元龟三年昇叙正三位権中纳言，作为幕府体系多年任官的公卿，他的石高别表另算享受美浓国十万石的特殊待遇。
织田信忠作为源义时的女婿，且又是西军总大将织田信长的遗孤，收拢织田家旧臣的作用和意义非常大，源义时给他尾张国半国二十万石领地，算的上给织田信长一个完整的交代，自己并没有亏待他的孩子。
伊达辉宗这些年功劳也有一些，只不过当年站错队领地被减封过一次，这次只是转封到出羽国庄内领二十万石作为恩赏，他的亲戚芦名盛氏及其子芦名盛隆没有立下多少功绩，当年又站错队减封过一次，这次被转封到米泽十八万石。
结城晴朝转封到陆奥国福岛五万石，小山秀纲转封到二本松五万石，大掾贞国转封南信浓伊那郡五万石，其亲族一门也转封到信浓等地，经过幕府允许着武藏千叶氏家督千叶胤宗，把嫡子过继给下総千叶氏家督千叶胤富为嗣子，两家合并举族转封到南信浓诹访郡、筑摩郡十万石，大浦为信转封加贺国十万石。
立花道雪转封到萨摩国五万石，高桥绍运转封到大隅国三万石，锅岛直茂转封日向国五万石，大友家、龙造寺家、相良家、秋月家等愿意降服幕府的遗臣皆转封到南九州萨摩、大隅两国，源义时对这两国的分割非常的细碎，绝对不给他们一家独大的机会，当然也不会给他们合纵连横的机会。
而萨摩、大隅两国领主的岛津家则得到极大的褒奖，被转封到肥前国六十万石，比起萨摩、大隅两国穷苦之地，雨水充沛土壤肥沃且有发达的贸易港口，这个肥前国简直是岛津家梦寐以求的家园，以后萨摩武士也不用在抱怨自家日子过的艰难。
明智光秀得到北近江小谷城附近的三郡，原属于浅井长政的领地，这块领地足有二十万石，作为这些年一直通风报信暗自协助幕府的奖赏，源义时还特别准许他恢复土岐氏的苗字，并拜认土岐赖芸作为养父，把老人家接到小谷城安度晚年。
说起来也挺有趣，当年明智光秀的祖父把女儿嫁给斋藤道三做正室，他的父亲和叔叔支持斋藤道三赶走宗家土岐赖芸，时隔四十年一番轮回又回到原点，明智光秀把他父亲和叔叔赶走的土岐赖芸迎过来作为养父，自己也改苗字土岐赖秀以替宗家传承家业，真不知道明智光秀见到年老多病的土岐赖芸时，会如何评价三十年前的风风雨雨。
转封到这里还没算完，转封的重头戏这才刚刚开始，不过他并没有急着完成所有转封，而是利用整整一年的时间不断的调整转封策略，给予各地国人领主安堵本领的文书，保证只要他们不触犯幕府的底线，不会行减封改易之令。
在京都忙碌一整年，直到元龟三年（1571年）春天，天皇与中宫源辉子诞下第一皇子和仁亲王的时候，他才意识到已经在京都呆了整整一年，准备带着家卷返回江户，又被寺社众的安置牵绊着短时间脱不开身。
幕府众与畿内各寺的高僧争吵不休，为一点一滴的利益可以兴致勃勃的辩论几个月，哪怕脾气再好也受不了，源义时就很生气地说道：“余的意志表达的很明确，寺社众豢养僧兵是治世的顽疾，山法师困扰朝廷幕府近千年，就连白河院这样的雄主也无可奈何，余决不会允许寺社豢养僧兵，任何名义上的都不允许。”
北畠顕房也很不高兴，这几个月里不是就幕府转封的方案争吵，就是听这些大和尚争吵，那么多事情没做完就是被这些自诩高僧的家伙拖住，阴着脸说道：“公方殿下的谕令尔等也不听吗？不要忘记你们是跳出红尘外不在五行中的方外之人，要那么多僧兵又岂会是没有私心，护院有幕府官军，要他们有何用？”
来自畿内各方的僧众闭口不语，没过片刻根来寺的僧团便抗议道：“护院僧兵可以不要，但是寺产是绝对不能削减的，纪州藩主真田幸隆带着幕府官军强占我根来寺的寺领，迫害我僧徒坊官其罪当诛，请公方殿下为我等做主！”
源义时冷哼一声道：“这个问题余已经解释过很多遍了，在这里最后重申一遍！幕府法令规定寺院不得恶意蓄产，由幕府寺社奉行虎哉宗乙大师管理僧籍僧录，根据各寺的寺丁拨付粮食、灯油、佛香、缁衣、麻鞋，寺社之中为逝者做水路法事、开光灌顶、化缘、举办法会、经营墓园等事物，这些收入足够让尔等丰衣足食不愁度日艰难，尔等切勿为贪图那些村庄寄进的领地而自误！”
一众僧众看到幕府将军的面色不愉，座下大将个个杀气腾腾，顿时想起这位将军可不是以前那些软弱的征夷大将军，他坐下那些个武士全是关东杀出来的可怕武士，一个眼神就能把人吓的两腿发软，举起太刀能让猛士转身逃跑，如地狱里的修罗夜叉让人惊惧。
幕府将军说最后一次重申，对他的家臣来说就一定是某种暗示，下一次说不定这些武士就举起手中的太刀砍杀他们，万一脑袋搬家岂不是亏到血本全无，毕竟脑袋是吃饭的家什，脑袋搬家再贪图那些便宜也就没意义了。
源义时深吸一口气，说道：“这些领地是幕府的而不是属于你们的！考虑到近畿各寺的特殊情况，余再给你们一年的时间，从今日起计算日期直至来年春天截止，在幕府奉行官的指引下把所有寺产交出来，期限内完成的寺社将既往不咎，超过期限也不用来找余下哭诉，等待你们的只有幕府的官军清剿，何去何从尔等自己掂量吧！”
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